食品是细菌的最佳“营养源”，再加上食品车间内大多温度、湿度较高，使得细菌大量的繁殖，导致菌落超标，消费者食用之后，轻则感觉口感不适，重则会引发食物中毒。另外，由于食品菌落太多，还使得食品保质期缩短。建设洁净车间，营造无尘无菌的环境，使得食品更加的卫生。

　　在洁净车间内生产食品，还可改良食品生产工艺，提升食品品质。比如我们经常食用的泡椒凤爪，若不在洁净车间加工，便需要有风干、辐射的工艺，风干主要是为了避免加工过程中出现腐烂的问题，但风干之后的口感不再鲜嫩，而若是在洁净车间中加工，那么便省去了风干、辐射的工艺，泡椒凤爪的品质更好。

　　目前我国的食品企业不少本质上仍只是“作坊”，既缺乏完善正规的加工工艺，也缺乏必要的卫生条件。建设洁净车间的同时，可以理顺生产工艺，更加规范，同时提供洁净的卫生环境，使得食品企业从“作坊型”向着“现代工业型”转型升级。随着人们生活水平的提高，对食品卫生要求也提高了很多，传统“作坊型”的食品企业若不转型升级，将在激烈的市场竞争中淘汰。

　　有数据显示，我国的食品出口合格率为99%，而国内的食品合格率为90%。许多人不相信国内的食品合格率为90%，即便是90%，还有9%的差距。建设洁净车间，是使得国内食品合格率达到99%的重要举措。