痕量分析的水质实验室其室内环境质量直接关系到实验数据的可靠性。在ISO/IEC 17025《检测和校准实验室能力的通用要求》中，对实验室净化的环境条件提出了明确的要求:“实验室应确保其环境条件不会使结果无效或对所要求的测量质量产生不良影响。”对痕量分析的水质实验室而言，影响室内环境质量的主要参数是洁净度、温度、湿度等。

据了解，在工业城市（污染地区），即使在沿海和农村地区（清洁地区），大气中的灰尘数量也可以达到3×105/L（≥0.5μm），大气中的尘埃数也可达到1×105个/L(≥0.5μm)。实验室净化中，环境空气中含有大量的悬浮微粒，其中均含有铜、铅、锌、锡、铬、镍、钡、钒钴等元素，有资料介绍其含量可达0.1μg/m2。一般敞开的室内每天接受降尘20μg/cm2，密闭的室内每天可接受降尘10μg/cm2。

因此，当样品的溶解，蒸发，灰化等操作花费很长时间时，它可能被空气污染。或者污染分析器具或者污染样品或者增加分析空白，严重影响分析质量。并且，实验室净化空气中还含有大量的细菌和霉菌，潮湿的灰尘沉积或扩散于精密仪器内，便使仪器内的电光元件发霉，影响分析仪器性能，缩短仪器使用寿命。因此，对于检测ppb级甚至于ppt级含量水质实验室而言，实验室内空气质量影响水质分析的问题应引起高度重视。

目前，在痕量分析实验室净化中尚无遵循提高空气清洁度要求的标准。电子行业或制药行业通常被用作参考。比较而言，根据目前水质分析仪器的检出限水平和水质标准各检测指标的浓度限值，以及当地空气环境质量状况来确定是否实施空气净化及其洁净度级别。一般来说，实验室净化中，理化分析达到十万级便能满足要求，微生物检测需更严格一点。

水质实验室试图在实验区进行空气净化改革，并根据不同的测试项目将清洁区分为四个等级。净化工程中的理化项目实验区均设置成10万级(105个/ft3，≥0.5μm)的空气洁净度;细菌及大肠菌等微生物实验的准备区设为10万级，准备区到检测区的过渡区设为万级(104个/ft3，≥0.5μm)，检测区设为千级，实验室净化的检测区内的操作面设为百级。从净化系统运行前后的室内环境质量看，效果是明显的。